黄山短尾猴除采食或嬉戏追逐时上树外，大部分时间都在地面活动。群居，受惊时，迅速结队从地面逃跑，但逃距不远。具弯竹垒柴习性。栖息于黄山密林之中，经常成群活动在峰林峡谷之间，攀峰登崖，如履平地，来时浩浩荡荡，漫山遍野，去时无影无踪，不知所向，被人们称为黄山上的精灵。令游人目不暇接。喜多岩石的疏林山坡。比较畏惧寒冷，昼行性、树栖的动物。除采食和夜宿多在树上外，白天大多在地面或矮树上活动。常在小河沟中翻石扒捞落在溪沟中的枯枝烂叶以寻找昆虫、草叶等作为食物。喜欢群居，每个群体的数量为10-30只不等。与中国其他猕猴类比较，地栖性更强，特别在受惊后多沿地面逃窜。黄山短尾猴游荡路线常较固定，在河边、竹林中运动时，常呈一定顺序，可在地上形成猴路。
喜群居，每群个体约30-80只不等，成年猴不甚活泼，饱食后常将颊囊中贮存的食物翻回口中慢慢咀嚼，或互相理毛，冬天喜欢依偎在石壁上晒太阳，第1顺位雄猴即猴王有时爬在高树上摇晃枝头。幼猴十分爱动，攀抓树枝互相打闹几无休止，常见4～5只幼猴吊成一串然后再由下而上翻回横枝。夜间坐在石壁上分成几个小堆挤在一起睡眠，幼猴多夹在大堆的中间，猴王和第1顺位雌猴在一起，但猴王和第2、3顺位雄猴常分堆睡眠。夏季（6-8月）分散在几棵相邻的大树上睡眠，以适应炎热的气候。猴群在一处活动几天后，便在巢区内漫游，迁移时成年雌猴在前，成年雄猴压队，仔猴吊在母猴腹下，响声小，速度快，日活动距离为1-2千米，夏季最长，秋季居次，春、冬季大致相等，在一处滞留天数为1-5天不等。受气候和植物物候期的影响，有明显的季节性垂直迁移现象。
